佐拉博士对宇宙魔方的研究其实非常肤浅，相比起能够横跨整个宇宙的效果来说，无论是之前传送核弹还是单兵瞬移装置都不过是小发明而已。
佐拉博士自以为可以掌控宇宙魔方但是之前不过是利用宇宙魔方的能量来制造各种产品和装置，当他真正使用完整的宇宙魔方进行传送时愕然发现自己失去了控制。
佐拉博士没能传送到预想中的第二个基地反而是来到了一颗略显荒芜的星球，九头蛇夫人运气好些，来到了位于丹佛市的仿生人大军中，这里目前已经被仿生人大军占据。
蝰蛇正准备使用自己的权限接管仿生人，结果却发现有些不对劲。
“怎么回事？为什么我控制不了这些人了？”
蝰蛇不知道的是，她的高级指令其实都需要佐拉博士确认才能执行，现在佐拉博士离开了地球，这些仿生人又被启动了自动模式因此蝰蛇并不能掌控这些仿生人。
佐拉博士对蝰蛇并没有完全信任。
“发现人类，目标检测中，目标为危险人物，清除计划开始执行。”基地已经启动自毁模式，仿生人的大数据库损毁现在无法辨别敌我只能将所有人类都按照基本规则进行判定。
可怜的九头蛇夫人到头来竟然被自己制造出来的仿生人大军给坑害了。
九头蛇夫人最强大的武器是她的毒液，在身体素质方面上虽然比普通人要强大一些可是在机器人大军面前没有太大用处。
伴随着一声惨叫，恶名昭彰甚至把雷神托尔给强上了的九头蛇夫人被子弹射成筛子。
相比起这两人的悲惨遭遇，雷神托尔要幸运的多，或许是魔剑的反抗效果亦或是因为自身强大，托尔没有被传送太远只是出现在九头蛇基地上。
“托尔？他怎么会出现在这里？”神奇先生击飞一个剑齿虎克隆体随后警惕的来到托尔身旁。
“你们是神盾局的人吧？快点离开这里，基地马上就要爆炸了！”托尔的魔剑在抵抗宇宙魔方传送的过程中耗费了大量能量，此时的托尔暂时恢复到正常状况。
之前在基地里的时候蝰蛇和佐拉太过自信以为将托尔成功洗脑后就万无一失，因此托尔也知道不少外界信息，托尔的遭遇有点像冬兵巴基。
“什么？你确定基地要自爆了？为什么？难道他们要转移到其它地方去了？”神奇先生等人还在费力砸开基地大门，结果托尔居然告诉他基地马上就要被毁了，这让牺牲了霹雳火的神奇先生无法接受。
托尔挥了挥自己的魔剑说道：“我把基地给毁了。”
说完不等这些人反应过来托尔就急忙朝着远处跑去，这些日子里他也见识到了中庭人类科技的恐怖之处，那核武器的爆炸威力即便是他也会粉身碎骨灰飞烟灭。
九头蛇基地的自爆虽然不知道会以什么样的方式，不过想来也是很危险事情。
看到托尔拔剑就跑，神奇先生作为这次复仇者联盟的队长有些犹豫，不过此时基地的确实有些异常，他的通讯恢复了正常不再受到干扰。
“理查兹，那些仿生人大军有些不对劲，行为模式发生了巨大变化……”
神盾局那边这个时候也传来了最新消息。
仿生人大军在拥有独立权限后发生了巨大变化，这变化就连发明者佐拉也未曾想到。
这些仿生人相互之间拥有万维网络连接，因此每个独立个体的AI程序此时串联到了一起形成了类似于蚁群的群体智慧大个体。这种方式避免了佐拉博士订下的基本规则，这些仿生人现在按照自己的推算得出个结论--人类是最大的祸害，没必要保留，需要全部清除。
因此原本还保持着杀二存一比例的仿生人大军开始大规模屠杀，只要是人类就全部都在必杀范围之中。
听到神盾局传来的消息，神奇先生有些相信托尔的话了，他对着正在奋战的众人说道：“大家先撤退，这基地有问题，很可能会自爆！”
众人对神奇先生还是比较信任的，听到命令急忙停下手中的动作且战且退，不过还有一个人没有听令。
那就是绿巨人浩克，此时的浩克正疯了似得往地板上砸，周围的敌人也放弃了对这个怪物的攻击任由他自己玩去。
“浩克，快离开，那里很危险。”神奇先生急忙上前阻止浩克，不过浩克却没有理会他依旧自己玩自己的。
“看我的。”石头人从地上举起一块巨大的混凝土块朝着浩克砸了过去。
“砰！”
浩克的脑袋被砸中，他转头看向石头人愤怒的扑了上去。
石头人急忙撒开退撤退，准备将浩克引开。
不过他明显高估了自己的速度，狂怒之下的浩克一个飞跃就追上了他随后将它按在地上疯狂摩擦，石头人的石头掉落满地。
其他人见状急忙上前帮忙，费了九牛二虎之力才堪堪将石头人救出，神奇先生则是当作沙包引开了绿巨人，以他的抗物理攻击能力其实一开始就该他来。
众人还没离开多远，山谷中就传来一声巨响。
好在这基地不是用核弹自爆，众人并没有受到辐射之类的二次伤害，不过基地基本上全都毁掉了那些剑齿虎克隆体逃走的数量不多。
“太好了，终于把基地给毁了，这下子战争要结束了吧。”彼得看着还在当作沙包任由浩克攻击的神奇先生说道。
然而神奇先生却没有这么乐观，他将自己化作橡皮绳子捆住浩克后对着蜘蛛侠说道：“我们的任务彻底失败了……”
“这么可能？总部基地不是被我们摧毁了么？难道这里不是他们总部？”蜘蛛侠不解的问道。
这个时候不知道从哪里冒出来的托尔插口道：“那里应该是他们的总部没错。”
“哎，我们的任务是要阻止那些仿生人大军，可是现在虽然摧毁了九头蛇总部，但是仿生人大军不仅没有停止工作而且变本加厉的对人类进行屠杀……”
神奇先生将神盾局传来的消息告诉给众人，胜利的喜悦顿时被阴云笼罩。